Top 10 Great Sites with Free Data Sets

# 2 Kaggle
# 4 BuzzFeed
# 5 Data.gov
# 7 Quandl

https://towardsdatascience.com/top-10-great-sites-with-free-data-sets-581ac8f6334

#database #data_analysis #free #sites


@bioinformatics101

Comments

Post a Comment

Popular posts from this blog

bioRxiv

بر اساس آنالیز انجام شده بر روی ۳۷۶۴۸ مقاله پیش-چاپ bioRxiv در ۵ سال، تعداد مقالات پیش-چاپ که محققان در سال ۲۰۱۸ در bioRxiv آپلود کرده‌اند، از کل ۴ سال پیش بیشتر می‌باشد. نتایج دیگری که از این آنالیز به‌دست آمد این بود که تعداد دانلود در ماه به یک میلیون رسیده است. بیشتر مقالات پیش-چاپ که آپلود و یا دانلود شده‌اند مربوط به رشته‌های نوروساینس و بیوانفورماتیک است. در رتبه سوم تا ششم نیز بیولوژی تکاملی، ژنتیک، ژنومیکس و میکروبیولوژی قرار دارند. همان طور که در تصویر مشخص است، تا همین اواخر بیوانفورماتیک بیشترین دانلود و آپلود را داشته است که این نشان‌دهنده اهمیت روز افزون این رشته در دنیا است. Reference: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/515643v1
Read more

نرمال‌سازی خوانش‌ها (Reads)

در مورد RPKM و FPKM و TPM که در آنالیز داده‌های RNAseq با آنها روبرو هستیم، اولی به معنی خوانش در هر هزارباز میلیون، دومی فرگمنت در هر هزارباز میلیون و سومی به معنی ترنسکریپت در میلیون است. اینکه از کدام باید استفاده کرد بر طبق این مقاله توصیه می‌شود که از TPM استفاده شود آن هم به این دلیل است که برای مقایسه نمونه‌های (کتابخانه‌ها) مختلف، می‌تواند یک مشکل بزرگ که عمق توالی‌یابی متفاوت در نمونه‌های مختلف است را حل کند. برای توضیحات بیشتر شما را به این مقاله رجوع می‌دهم. 📣 لطفا به اشتراک بگذارید https://link.springer.com/article/10.1007/s12064-012-0162-3 #rnaseq #normalizing #paper #analyzing @bioinformatics101
Read more